خیرین حوزه های علمیه در سال 1400 هجری شمسی زیر نظر حضرت آیت الله اعرافی مدیر محترم حوزه های علمیه آغاز بکار کرد. اهداف کلان این بنیاد ترویج فرهنگ اهل بیت علیهم السلام و توسعه نهاد علم، حفظ استقلال مالی حوزه های علمیه، رفع نیاز طلاب و مدارس علمیه می باشد.